(一)治療
1.非手術治療
(1)全身使用抗生素：主要針對革蘭陰性桿菌和厭氧菌。一般使用氨基糖苷類和青霉素類加甲硝唑或林可霉素，后二者對厭氧菌的療效較好。
(2)通便：肛周膿腫時常伴便秘，通便可減輕排便時的癥狀。
(3)臥床休息，靜脈補充能量及維生素。
(4)局部療法：如理療、外敷中藥或用抗生素作局部注射等。
2.手術治療 肛周感染除非是早期，否則一般治療難以奏效。因此手術治療實際上是治療肛周感染的主要手段。有學者認為手術切開對治療肛周感染并不存在時機問題，因為切開不僅僅可以排出膿液，還可以對并不完全化膿的化膿性感染有減壓引流作用，有利于炎癥的消除。也有學者對時機問題作出這樣評價，認為多半是治療醫(yī)師對本病診斷不清和手術切開技術沒有把握的托詞而已。喻德洪等認為所謂時機問題實際上還是存在的，這是因為并非所有肛周感染一旦發(fā)生就需手術切開，這里還有個體化問題。以下幾點可作為手術切開時的參考：①感染癥狀持續(xù)2～3天經治療無好轉或進一步加重，此時膿腫往往已開始形成，即使無波動感也應考慮切開;②經穿刺抽出膿液者;③感染處有波動感者;④深部膿腫B超或CT提示有液化者。
手術切開的原則是排出膿液，清除壞死組織，保持引流通暢。不同部位的膿腫，其手術操作不盡相同。
(1)肛周皮下膿腫：切開方式有2種，可在局部麻醉下進行。①單純膿腫，做放射狀切口，排出膿液，沖洗膿腔，示指伸入膿腔分離間隙，最后放置碘仿或凡士林紗布條作引流(圖8);②膿腫與肛隱窩相通，膿腫切開后應用探針仔細尋找內口，敞開引流，如內口較深可同時行掛線治療。
(2)坐骨直腸窩膿腫：手術一般在骶麻下進行，穿刺抽得膿液后，距肛門約2.5cm作一前后方向的切口，切口要求有足夠的長度，伸入示指分離膿腔間隔，置油紗布條引流。
(3)骨盆直腸間隙膿腫：手術切口如同坐骨直腸窩膿腫，術者用彎血管鉗經坐骨直腸間隙穿過肛提肌進入膿腔，手指分開肛提肌纖維，膿腔內置入膠管引流。也可采用直腸內徑路，用窺器顯露膿腫部腸壁并切開，置入蕈狀導尿管。術后用抗生素液沖洗膿腔，3～5天后拔除引流管。
肛管直腸周圍膿腫的治療在于早期切開引流，這是控制感染及減少肛瘺形成的關鍵。術中注意：①定位要準確：一般在膿腫切開引流前應先穿刺，抽出膿液后，再行切開引流。②切口：淺部膿腫行放射狀切口，深部膿腫行直切口，避免損傷括約肌。③引流要徹底：切開膿腫后要用手指去探查膿腔，分開膿腫內的纖維間隔，以利引流。④預防肛瘺形成：術中應仔細尋找有無內口，即原發(fā)性肛隱窩，若能同時切開，常可防止肛瘺形成，但此方法應限于有經驗的醫(yī)生進行。⑤術中應行膿液培養(yǎng)，協(xié)助判斷有無肛瘺，若為白色葡萄球菌，肛瘺機會極少，若為大腸埃希桿菌及混合感染，則肛瘺機會多。對復雜的肛周化膿性疾病，臨床無法明確的膿腫，可用肛管超聲(AUS)檢查，有助于確定膿腫和瘺與括約肌的解剖關系，偶爾還能識別內口。Ferguson醫(yī)院(1987～1990)對24例術前診斷為直腸周圍膿腫和瘺者，術中采用AUS檢查，采用的儀器為焦距2～5cm的7MHz的肛內超聲儀。24例中術中發(fā)現(xiàn)19例直腸周圍膿腫，其中12例(63%)AUS提供了膿腔與括約肌之間的關系，都經手術證實。5例AUS未發(fā)現(xiàn)有膿腫，其后在麻醉下檢查也未發(fā)現(xiàn)。說明AUS對復雜的肛周感染，提供了重要的輔助手段。
(4)直腸后膿腫：切開引流與坐骨直腸窩膿腫基本相同，但其切口更偏向后方。經皮膚穿刺抽出膿液后，用彎血管鉗經切口向直腸后方插入膿腔排凈膿液。沖洗膿腔后置橡皮管或卷煙引流。
(5)高位肌間膿腫：在腰麻或骶麻下，用兩葉張開式肛門鏡顯露膿腫，一般不直接在膿腫處切開引流，以防出血。最好在齒狀線上先找到內口，然后自內口處插入一有槽探針，向上約2～2.5cm，自黏膜外穿出;再用另一細探針，一端先系緊兩根粗絲線，沿有槽探針處進入，用該絲線將兩側的黏膜及肌層結扎，這可致組織壞死。約4～5天膿腫完全開放。若內口未找到，則在膿腫下端黏膜處作一小的刺傷，然后用上法切開。若膿腫已破裂，開口能容納一指尖，常已達到引流目的，若開口小則需擴大引流。
(二)預后
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