本病的一般表現(xiàn)是，患者先感肛門處墜脹痛或刺痛，可捫及一硬塊，壓痛，繼之疼痛加重，痛性腫塊增大，并可出現(xiàn)畏寒、發(fā)熱。在3～5天后局部可形成膿腫。低位膿腫局部癥狀重而全身癥狀輕;高位膿腫全身癥狀重而局部癥狀輕。膿腫可自行向肛管直腸內(nèi)破潰自發(fā)排出膿液，排膿后疼痛緩解，全身癥狀好轉(zhuǎn)或消失。形成肛瘺以后膿腫可反復(fù)發(fā)作。
由于膿腫發(fā)生部位不同，其癥狀體征也各有特點：
1.肛周皮下膿腫 占肛管直腸周圍膿腫的40%～45%，位于肛門、肛管下部的皮下組織內(nèi)，上方由筋膜與坐骨直腸間隙分隔。多發(fā)生于肛門后側(cè)方。肛門區(qū)腫脹疼痛是本病的主要癥狀。檢查時可見局部紅腫，壓痛及痛性硬塊，化膿后有波動感，自行穿破者可見破口及膿液。本病診斷較易，如疑有膿腫形成，作穿刺即可證實。
2.坐骨直腸窩膿腫 占肛周膿腫的15%～25%，位于坐骨直腸窩內(nèi)。坐骨直腸間隙呈楔形，在肛提肌與坐骨之間，底向下是肛門和坐骨結(jié)節(jié)之間的皮膚，尖向上在閉孔內(nèi)肌筋膜與肛提肌的膜連接處。炎癥初起時常覺肛門部不適或微痛，繼之出現(xiàn)全身癥狀，如頭痛、體溫升高、脈搏加快、畏寒等，同時局部疼痛加重，坐臥不安，排便時疼痛尤重。有排尿困難，里急后重。查體時可見肛門旁腫脹，皮膚紫紅變硬，指診可捫及坐骨直腸窩飽滿隆起、觸痛。早期作坐骨直腸窩穿刺是發(fā)現(xiàn)膿腫的最簡單有效辦法。
3.骨盆直腸間隙膿腫 約占肛周膿腫的2.5%～9%，骨盆直腸間隙位于盆腔內(nèi)，下為肛提肌，上為盆腔腹膜，后有直腸和側(cè)韌帶。前方男為膀胱和前列腺，女為子宮和闊韌帶。膿腫發(fā)生后主要表現(xiàn)為全身中毒癥狀，肛門局部表現(xiàn)不明顯，指診在肛提肌上方可摸到腫脹和觸痛。由于感染位置較深，早期診斷不易，故對全身性感染中毒癥狀，乃至感染性休克而找不到病灶者要考慮本病可能，B超或CT檢查可幫助診斷。
4.馬蹄形膿腫 馬蹄形膿腫是在肛門、肛管后方及兩側(cè)蔓延的膿腫，多數(shù)在后方，由后中肛腺感染所致或一側(cè)膿腫向?qū)?cè)蔓延所致，可分為高位馬蹄形膿腫和低位馬蹄形膿腫。臨床表現(xiàn)除全身感染癥狀外，局部表現(xiàn)為肛管后方腫脹及觸痛，后期破潰流膿。
1.臨床癥狀 肛周持續(xù)性劇痛、受壓或咳嗽時加重;可有全身乏力、發(fā)熱等感染表現(xiàn)。
2.體征 肛旁皮膚有明顯紅斑，伴硬結(jié)和觸痛，可以波動感,為肛周膿腫;直腸指診，患側(cè)有壓痛性腫塊為坐骨直腸窩膿腫;直腸上部的前側(cè)壁外有壓痛、隆起為骨盆直腸膿腫;直腸指診在直腸后壁有壓痛、隆起和波動感，為直腸后壁膿腫。高位肌間膿腫，肛周外觀無特殊，直腸指診在肛管上端或下端捫及表面光滑、卵圓形、邊緣整齊、質(zhì)硬、壓痛的腫塊，或有波動者為高位肌間膿腫。
3.肛門鏡檢 有時可看到開口，若在周圍加壓，還可見到膿液自開口流出。

肛周膿腫擴(kuò)張到坐骨直腸窩時，易與血栓性外痔相混淆，應(yīng)注意鑒別。