臨床表現(xiàn)多種多樣，大體上類似于其他的兼性革蘭染色陰性桿菌?？杀憩F(xiàn)為皮膚、軟組織、呼吸道、泌尿道、中樞神經(jīng)系統(tǒng)、胃腸道和其他的器官的感染。
1.敗血癥 多發(fā)生在老人或新生兒中，有時(shí)伴有其他細(xì)菌混合感染。在成人和兒童中常伴發(fā)熱，并多有寒戰(zhàn)?；颊邿嵝筒灰唬蔀榛魺?、間歇熱、弛張熱等?？砂榈脱獕夯蛐菘??；颊叨啾憩F(xiàn)為白細(xì)胞增多，也有少部分患者表現(xiàn)為白細(xì)胞減少。偶爾報(bào)道有血小板減少癥、出血、黃疸、彌散性血管內(nèi)凝血者。大多同時(shí)有皮膚癥狀，如紫癜、出血性水皰、膿皰瘡等。
2.下呼吸道感染 患者一般均有嚴(yán)重基礎(chǔ)疾病尤以慢性阻塞性肺病及支氣管肺癌為多。感染者常已在使用抗生素，并常有各種因素所致的免疫能力低下如使用免疫抑制劑、激素應(yīng)用、化療放療等。誘發(fā)因素：以安置呼吸機(jī)最多，其他有氣管切開、氣管插管、胸腔穿刺、動(dòng)靜脈插管、導(dǎo)尿、全身麻醉等。可有發(fā)熱甚至高熱，多有咳痰，痰液可為白色、膿性或帶血絲，但在老年人中癥狀較少甚至無癥狀?？捎泻粑贝?，心動(dòng)過速。感染可以表現(xiàn)為支氣管炎、肺炎、肺膿腫、胸腔積液。休克和轉(zhuǎn)移性病灶少見。X線表現(xiàn)不一，可以是葉性、支氣管炎性、空隙性或混合性，可以為單葉病變、多葉病變或彌漫性雙側(cè)病變等。
3.傷口感染 常見于燒傷創(chuàng)口、手術(shù)切口的感染。隨著各種手術(shù)的開展，幾乎各處都可有該菌感染，尤以胸骨縱隔和脊柱后方相對(duì)多見。
4.軟組織感染 在社區(qū)中感染的常見形式，如指甲下血腫、摔傷后軟組織感染。
5.心內(nèi)膜炎 危險(xiǎn)度最高的是靜脈藥癮者、人工瓣膜術(shù)后、心臟手術(shù)后患
6.腹部感染 由于該菌的遷徙或腸道穿孔到達(dá)腹膜或其他臟器而發(fā)病。目前胃腸源性的感染中該菌漸受重視，尤其在肝移植相關(guān)性感染者中更為多見。其他如肝的氣性壞疽，急性氣腫性膽囊炎和逆行胰膽管造影術(shù)后敗血癥，膽石淤積所致間歇梗阻的急性化膿性膽管炎，不伴腹水或穿孔的繼發(fā)于小腸梗阻后的腹膜炎等。
7.泌尿道感染 從無癥狀性細(xì)菌尿到腎盂腎炎均有報(bào)道。
8.中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染 陰溝腸桿菌可引起腦膜炎、腦室炎、腦膿腫等。
9.眼部感染 眼部手術(shù)是常見誘因，白內(nèi)障手術(shù)多在老年人中進(jìn)行，因而成為此類感染常見原因。
根據(jù)各系統(tǒng)的臨床表現(xiàn)、實(shí)驗(yàn)室檢查等可判斷感染發(fā)生的部位，細(xì)菌培養(yǎng)到陰溝腸桿菌為確診依據(jù)，應(yīng)注意免疫力低下的患者感染的臨床表現(xiàn)可不典型。陰溝腸桿菌感染應(yīng)注意與其他革蘭陰性桿菌感染相鑒別，確診需培養(yǎng)或涂片檢測(cè)到陰溝腸桿菌。

陰溝腸桿菌敗血癥需與傷寒或副傷寒進(jìn)行鑒別。