腸結(jié)核的臨床表現(xiàn)在早期多不明顯，多數(shù)起病緩慢，病程較長，如與腸外結(jié)核并存，其臨床表現(xiàn)可被遮蓋而被忽略，因此，活動性腸外結(jié)核病例如出現(xiàn)明顯的消化道癥狀，應(yīng)警惕腸結(jié)核存在的可能性，本病主要臨床表現(xiàn)可歸納如下：
1.腹痛是本病常見癥狀之一，疼痛多位于右下腹，反映出腸結(jié)核好發(fā)于回盲部的病理特征;然而也可在中上腹或臍周，系回盲部病變引起的牽涉痛，經(jīng)仔細檢查可發(fā)現(xiàn)右下腹壓痛點，疼痛性質(zhì)一般為隱痛或鈍痛，有時在進餐時誘發(fā)，由于回盲部病變使胃回腸反射或胃結(jié)腸反射亢進，進食促使病變腸曲痙攣或蠕動加強，從而出現(xiàn)疼痛與排便，便后可有不同程度的緩解，在增生型腸結(jié)核或并發(fā)腸梗阻時，有腹絞痛，常位于右下腹，伴有腹脹，腸鳴音亢進，腸型與蠕動波。
2.大便習(xí)慣異常由于病變腸曲的炎癥和潰瘍使腸蠕動加速，腸排空過快，以及由此造成的繼發(fā)性吸收不良，因此腹瀉是潰瘍型腸結(jié)核的主要臨床表現(xiàn)之一，腹瀉常具有小腸性特征，糞便呈糊樣或水樣，不含黏液或膿血，不伴有里急后重，一般每天排便約2～4次，如果病變嚴重，涉及范圍較廣，則腹瀉次數(shù)增多，有達每天十余次者，潰瘍涉及乙狀結(jié)腸或橫結(jié)腸時，大便可含黏液，膿液，但便血者少見，此外，間有便秘，大便呈羊糞狀，腹瀉與便秘交替，在增生型腸結(jié)核多以便秘為主要表現(xiàn)。
3.腹部腫塊主要見于增生型腸結(jié)核，系極度增生的結(jié)核性肉芽腫使腸壁呈瘤樣腫塊，在少數(shù)潰瘍型腸結(jié)核合并有局限性結(jié)核性腹膜炎者，因其病變腸曲和周圍組織粘連，或包括有腸系膜淋巴結(jié)結(jié)核，也可出現(xiàn)腹部腫塊，腹部腫塊常位于右下腹，一般比較固定，中等質(zhì)地，伴有輕重不等的壓痛。
4.全身癥狀和腸外結(jié)核的表現(xiàn)常有結(jié)核毒血癥，以潰瘍型腸結(jié)核為多見，表現(xiàn)輕重不一，多數(shù)為午后低熱或不規(guī)則熱，弛張熱或稽留熱，伴有盜汗，患者倦怠，消瘦，蒼白，隨病程發(fā)展而出現(xiàn)維生素缺乏，脂肪肝，營養(yǎng)不良性水腫等表現(xiàn)，此外，也可同時有腸外結(jié)核，特別是腸系膜淋巴結(jié)結(jié)核，結(jié)核性腹膜炎，肺結(jié)核的有關(guān)表現(xiàn)，增生型腸結(jié)核一般病程較大，但全身情況較好，無發(fā)熱或有時低熱，多不伴有活動性肺結(jié)核或其他腸外結(jié)核證據(jù)。
5.腹部體征無腸穿孔，腸梗阻或伴有腹膜結(jié)核或增生型腸結(jié)核的病例，除在右下腹部及臍周有壓痛外，通常無其他特殊體征。