慢性病人可出現(xiàn)貧血和營養(yǎng)不良。此外腸壁組織在急、慢性期受到不同的損害，可引起以下幾種合并癥。
1、腸穿孔造成腹膜炎 曾氏報告254例阿米巴痢疾病人，手術(shù)及尸解證明有腸穿孔者19例，為7.48%。Adams報道3013例中97例發(fā)生了腹膜炎(3.2%)，發(fā)生率雖不很高，但預(yù)后差。
2、阿米巴性闌尾炎 Clark報告186例阿米巴病人的尸解中，40%有闌尾炎。Criag報告60例中26.67%合并有闌尾炎。發(fā)生率確實比較高。故在阿米巴病高發(fā)地區(qū)，許多急腹癥是由阿米巴性闌尾炎或阿米巴性闌尾穿孔造成。
3、腸狹窄 慢性阿米巴結(jié)腸炎病人，腸壁組織增生、肥厚以及阿米巴肉芽腫形成，導(dǎo)致狹窄。少數(shù)病人甚至形成腸梗阻而需手術(shù)治療。
4、阿米巴瘤 Adams報告的3013例病人中，15例發(fā)生了阿米巴瘤(0.5%)。
5、非特異性潰瘍性結(jié)腸炎 阿米巴原蟲已被徹底消滅，轉(zhuǎn)變成非特異性潰瘍性結(jié)腸炎。Adams的統(tǒng)計中，有21例(0.7%)。
此外比較少見的還有腸道大出血、腸息肉及腸套疊等。