（1）中毒性結(jié)腸擴張　在急性活動期發(fā)生，發(fā)生率約2%。是由于炎癥波及結(jié)腸肌層及肌間神經(jīng)叢，以至腸壁張力低下，呈階段性麻痹，腸內(nèi)容物和氣體大量積聚，從而引起急性結(jié)腸擴張，腸壁變薄，病變多見于乙狀結(jié)腸或橫結(jié)腸。誘因有低血鉀、鋇劑灌腸，使用抗膽堿能藥物或鴉片類藥物等。臨床表現(xiàn)為病情迅速惡化，中毒癥狀明顯，伴腹脹、壓痛、反跳痛，腸鳴音減弱或消失，白細胞增多。X線腹平片可見腸腔加寬、結(jié)腸袋消失等。易并發(fā)腸穿孔。病死率高。
（2）腸穿孔　發(fā)生率為1.8%左右。多在中毒性結(jié)腸擴張基礎(chǔ)上發(fā)生，引起彌漫性腹膜炎，出現(xiàn)膈下游離氣體。
（3）大出血 是指出血量大而要輸血治療者，其發(fā)生率為1.1%～4.0%。除因潰瘍累及血管發(fā)生出血外，低凝血酶原血癥亦是重要原因。
（4）息肉　本病的息肉并發(fā)率為9.7%～39%。常稱這種息肉為假性息肉。有人其此分為黏膜下垂型、炎型息肉型、腺瘤樣息肉型。息肉好發(fā)部位在直腸，也有人認為降結(jié)腸及乙狀結(jié)腸最多，向上依次減少。其結(jié)局可隨炎癥的痊愈而消失，隨潰瘍的形成而破壞，長期存留或癌變。癌變主要是來自腺癌息肉型。
（5）癌變 發(fā)生率報道不一，有研究認為比無結(jié)腸炎者高多倍。多見于結(jié)腸炎病變累及全結(jié)腸、幼年起病和病史超過10年者。
（6）小腸炎 并發(fā)小腸炎的病變主要在回腸遠端，表現(xiàn)為臍周或右下腹痛，水樣便及脂肪便，使患者全身衰竭進度加速。
（7）與自身免疫反應(yīng)有關(guān)的并發(fā)癥　常見者有：
①關(guān)節(jié)炎：潰瘍性結(jié)腸炎并發(fā)關(guān)節(jié)炎率為11.5%左右，其特點是多在腸炎病變嚴(yán)重階段并發(fā)。以大關(guān)節(jié)受累較多見，且常為單個關(guān)節(jié)病變。關(guān)節(jié)腫脹、滑膜積液，而骨關(guān)節(jié)無損害。無風(fēng)濕病血清學(xué)方面的改變。且常與眼部及皮膚特異性并發(fā)癥同時存在。
②皮膚黏膜病變：結(jié)節(jié)性紅斑為多見，發(fā)生率為4.7%～6.2%。其他如多發(fā)性膿腫、局限性膿腫、膿皰性壞疽、多形紅斑等?？谇火つゎB固性潰瘍亦不少見，有時為鵝口瘡，治療效果不佳。
③眼部病變：有虹膜炎、虹膜睫狀體、葡萄膜炎、角膜潰瘍等。以前者最多，發(fā)病率約5%～10%。
（8）其他并發(fā)癥 結(jié)腸腔狹窄、肛門膿腫、瘺管、貧血、肝損害及腎損害。此外，尚有心肌炎、栓塞性血管炎、胰腺萎縮及內(nèi)分泌障礙等。