1.呼吸道并發(fā)癥 約在10%的病人中發(fā)生，兒童中更明顯，因反流嘔吐發(fā)生吸入性肺炎、支氣管擴張、肺膿腫及肺纖維化為最常見。吸入非典型分枝桿菌合并食管內潴留的油脂可誘發(fā)慢性肺部改變，類似臨床及X線的結核病。在痰中找到抗酸菌，可能為非典型分枝桿菌，不要誤認為結核桿菌。有3種機制可以造成呼吸道并發(fā)癥：①食物內容物吸入氣管或支氣管，食管反流物被呼入氣道時可引起支氣管和肺部感染，尤其在熟睡時更易發(fā)生。約1/3患者可出現(xiàn)夜間陣發(fā)性嗆咳或反復呼吸道感染。最經(jīng)常發(fā)生于有擴張的食管，尤其在夜間平臥時，反復少量誤吸，并伴有咳嗽、喘鳴、氣短等癥狀;②明顯擴大及充盈的食管發(fā)生氣管壓迫，使呼吸及排痰不暢;③并發(fā)癌腫造成食管及氣管，或左支氣管間瘺管，可造成嚴重的呼吸道癥狀。其中以第①項最常見。治療的方法只有在解除食管梗阻后，才能使肺部并發(fā)癥好轉。肺部不可逆性病變有時可與食管同時進行外科處理。
2.癌腫 據(jù)報道2%～7%的病人可合并食管癌，尤其病程在10年以上、食管擴張明顯、潴留嚴重者。主因食物潴留發(fā)生食管炎的慢性炎癥刺激因素造成。食管肌層切開或擴張術后并不能預防癌腫的發(fā)生，有手術成功后多年仍可發(fā)生癌腫的報道。因此，應仔細觀察有無并發(fā)食管癌，遇有可疑情況，進行活體組織學檢查。黃國俊及張煒等分別報道失弛緩病合并食管癌患者性別發(fā)生率與食管癌相似，以男性為主，但癌并發(fā)失弛緩癥的發(fā)病年齡較食管癌病人為輕。有失弛緩癥者平均年齡為48～51歲，無失弛緩癥人年齡62～67歲。腫瘤多見發(fā)生于食管中段，其次為食管下段及上段。
診斷常延誤，因病人的消化道癥狀常被誤認為失弛緩癥，待癌腫生長至較大體積發(fā)生堵塞擴大的食管才注意。癥狀是體重下降，吞咽困難從間歇變?yōu)檫M行性，反流嘔吐出現(xiàn)血染性物或貧血時才被發(fā)現(xiàn)。疑并發(fā)有食管癌病例除鋇餐X線檢查外，做內鏡活檢及細胞學刷檢。
3.食管炎 由于失弛緩癥的食管內食物潴留，內鏡檢查可見到有食管炎及其造成的黏膜潰瘍，潰瘍可發(fā)生出血，少數(shù)發(fā)生自發(fā)性穿孔，食管氣管瘺。身體衰弱或已接受抗生素治療或粒細胞減少者可合并念珠菌感染。內鏡中見在炎性黏膜上有白斑。標本涂片及活檢可以確診。治療應首先行擴張解除食管潴留，病情不能耐受強力擴張者可用吸引引流以保持食管排空，同時應用抗生素。
4.賁門失弛緩癥可以并發(fā)食管癌或賁門癌,發(fā)生率為315 % 。原因可能為食管黏膜長期受到潴留物刺激,發(fā)生潰瘍,黏膜上皮增生惡變等。
5.其他并發(fā)癥 由于失弛緩癥的食管擴張，使管腔內張力增加，發(fā)生膈上膨出型憩室的并發(fā)癥，可隨失弛緩治療的同時處理。少數(shù)病人發(fā)生類似類風濕關節(jié)炎的關節(jié)并發(fā)癥，治療失弛緩癥后癥狀可緩解。