1.泌尿系梗阻 腎結(jié)石結(jié)石致泌尿系管腔內(nèi)堵塞可造成梗阻部位以上的積水。結(jié)石性梗阻常為不完全性梗阻，有的結(jié)石表面有小溝，尿液可沿小溝通過;有時結(jié)石雖較大，甚至呈鑄狀結(jié)石，但尿仍能沿結(jié)石周圍流出，也可能在長時間內(nèi)不引起積水，腎盂壁纖維組織增生變厚時，則擴張表現(xiàn)不明顯。
腎結(jié)石發(fā)生梗阻由于發(fā)病緩急不同，其臨床表現(xiàn)有很大差異。盡管最終均可引起腎盂積水，但臨床不一定以腎盂積水為主要表現(xiàn)。腎盂積水有時無任何臨床癥狀，部分病例直到腎盂積水達嚴(yán)重程度，腹部出現(xiàn)腫物和腎功能不全，甚至無尿時才被發(fā)現(xiàn)。
2.局部損傷 小而活動度大的結(jié)石，對局部組織的損傷很輕，大而固定的鹿角狀結(jié)石可使腎盞、腎盂上皮細胞脫落，出現(xiàn)潰瘍、纖維組織增生、中性粒細胞和淋巴細胞浸潤，以致纖維化。移行上皮細胞長期受結(jié)石刺激后，可發(fā)生鱗狀上皮細胞化生、甚至可引起鱗狀上皮細胞癌，因此應(yīng)做尿脫落細胞學(xué)檢查。盡管尿脫落細胞異常不一定能使之確診，但從中可獲得尿路上皮細胞發(fā)生異常改變的提示。對于長期存在的腎盂或膀胱結(jié)石都要想到上皮細胞癌變的可能，手術(shù)時應(yīng)取活體組織送快速冰凍切片檢查。
3.感染 有無感染對腎結(jié)石的治療和防治有重要意義。尿路感染病人臨床表現(xiàn)為發(fā)熱、腰痛、尿中出現(xiàn)膿細胞。尿培養(yǎng)有細菌時，應(yīng)同時做藥敏試驗。
結(jié)石合并感染時，可加速結(jié)石的增長和腎實質(zhì)的損害。在結(jié)石排出或取出前，這種感染很難治愈，可發(fā)生腎盂腎炎、腎積膿、腎周圍炎、嚴(yán)重者甚至可發(fā)展為腎周圍膿腫;與腹膜粘連后，可穿破入腸管。顯微鏡下可見腎間質(zhì)炎癥，細胞浸潤和纖維化，腎小管內(nèi)有中性粒細胞和上皮細胞，后期出現(xiàn)腎小管萎縮和腎小球硬化。
4.腎功能不全 腎結(jié)石在合并尿路梗阻時，尤其是雙側(cè)尿路梗阻或在此基礎(chǔ)上合并嚴(yán)重感染，病人可出現(xiàn)腎功能不全。當(dāng)梗阻解除和(或)感染得到有效控制，部分病人。腎功能可好轉(zhuǎn)或恢復(fù)正常。
判斷腎功能的方法除檢測血清尿素氮、肌酐和內(nèi)生肌酐清除外，還可采用靜脈腎盂造影術(shù)并根據(jù)造影劑排出的時間、濃度加以判斷。B超雖可了解尿路擴張情況和腎實質(zhì)的厚度，但判斷腎功能較為困難。靜態(tài)或動態(tài)核素掃描或攝像可提供有價值的線索。因為梗阻和腎損害隨結(jié)石移動部位的變化，以及治療的不同階段而發(fā)生的變化，所以腎結(jié)石病人需要隨診監(jiān)測，尤其動態(tài)掃描了解腎實質(zhì)的情況。當(dāng)結(jié)石排出后，或在引流后，這種檢查可對預(yù)后或進一步處理提供依據(jù)。
5.腎鈣質(zhì)沉積癥 鈣質(zhì)在腎組織內(nèi)沉著，多發(fā)生于有高血鈣患者。原發(fā)性甲狀旁腺功能亢進、腎小管酸中毒和慢性腎盂腎炎患者，可有腎鈣質(zhì)沉淀。鈣質(zhì)主要沉淀在髓質(zhì)內(nèi)。病變嚴(yán)重時，全部腎實質(zhì)都可有鈣沉著，導(dǎo)致間質(zhì)纖維化，腎小球硬化和腎小管萎縮。
6.腎組織為脂肪組織代替 腎結(jié)石腎盂腎炎的腎組織萎縮后可為脂肪組織所代替。腎臟維持其原形但普遍縮小。腎包膜與腎的表面緊密粘連，腎組織萎縮而硬化。嚴(yán)重病例所剩腎組織極少，甚至完全消失。腎實質(zhì)與腎盂腎盞間為灰黃色的脂肪組織所填充。
7.胃腸道癥狀、貧血等。