在研究了人類基因組未被探索的區(qū)域之后,研究人員發(fā)現(xiàn)了一種新的非編碼基因,它似乎在癌癥的發(fā)展中起著重要作用。
該基因位于基因組的一個區(qū)域,不包含制造蛋白質的指令。有一次,有人認為這個非編碼區(qū)只是無關緊要的“垃圾”。
然而,隨著技術的進步,越來越多的基因被發(fā)現(xiàn)在這個“暗物質”中,這對健康和疾病都是重要的。
在《細胞》雜志,科學家報告說,雖然新的基因并沒有編碼蛋白質,但它對癌細胞有“直接影響”。他們發(fā)現(xiàn)沉默可以阻止腫瘤的生長。
DNA和RNA,基因組和轉錄組
人類基因組包含建立和維持細胞所需的所有指令。它攜帶著這一信息,在一個叫做DNA的長、彎曲、雙鏈分子中,有20000-25000個基因。
DNA中包含的指令并不是直接從那里得到的。它首先被“轉錄”成一個被稱為RNA的單鏈分子,它反映了DNA序列,并且所有在細胞中保存的轉錄本被稱為細胞的“轉錄組”。
因此,雖然基因組很少因細胞而異,但轉錄組的變化取決于細胞的類型。
通過對RNA的分析,研究人員應該能夠發(fā)現(xiàn)在不同的細胞中DNA的基因是如何和何時被開啟和關閉的。
例如,分析轉錄組可能會發(fā)現(xiàn),一個未知的基因在癌細胞中高度表達,而不是在健康細胞中。這可能表明該基因對細胞生長很重要。
非編碼基因不一定是“垃圾”
轉錄組被保存在幾種不同的RNA中。主要的信使RNA(mRNA)攜帶的是制造蛋白質的腳本或代碼,這些蛋白質是在細胞中做大量工作的分子。非編碼rna攜帶從DNA中轉錄而不是合成蛋白質的腳本。
很長一段時間以來,人們都認為不含制造蛋白質指令的大部分基因組是垃圾DNA。這些所謂的非編碼基因也被稱為暗物質,因為人們對它們知之甚少。
但隨著測序技術的進步,科學家們發(fā)現(xiàn),雖然基因組的暗物質可能不會最終產(chǎn)生蛋白質,但它確實產(chǎn)生了非編碼rna,在健康和疾病的細胞生物學中發(fā)揮著重要作用。
在過去的20年里,發(fā)現(xiàn)了許多新的非編碼RNA,其中包括一種稱為長非編碼RNA的RNA(lncRNA),它是一種有超過200個構建塊或核苷酸的RNA鏈。
在新的研究報告中,研究人員描述了他們如何發(fā)現(xiàn)并描述了一個lncRNA,他們發(fā)現(xiàn)它們在斑馬魚、老鼠和人類身上都是一樣的。
這引起了他們的好奇心,因為在不同物種間發(fā)現(xiàn)這種“保守”的RNA是罕見的。這是否意味著它在細胞生物學中發(fā)揮了重要作用?
他們將lncRNA命名為“睪丸相關的高度保守的長非編碼RNA”(THOR)。
資深研究作者、密歇根大學(MichiganMedicine)的病理學教授ArulChinnaiyan說,他們決定把注意力集中在THOR身上,因為它似乎“被進化選擇了重要的功能。”
研究人員發(fā)現(xiàn),高度保守的lncRNA對癌癥的發(fā)展非常重要,沉默阻止了腫瘤的生長。
THOR在癌細胞中高度表達
在之前的研究中,他們已經(jīng)確定了數(shù)千種潛在的lncrna,這些潛在的lncrna在繪制暗物質的圖景后可能會更有用。他們選擇研究THOR有兩個原因:第一,因為它是“進化高度保守的”,其次,因為它只在一種正常的成人組織中高度表達:睪丸。
Chinnaiyan教授說,因為在斑馬魚和人類和老鼠身上,THOR是高度保守的,所以他們能夠研究它在斑馬魚模型中的作用。
但是,當他們進一步調查THOR時,他們發(fā)現(xiàn)它在某些癌癥,特別是黑素瘤和肺癌中也有很高的表達,并且它在癌癥的發(fā)展中起到了直接的作用。
使用實驗室培育的癌細胞表達THOR的實驗表明,沉默該基因會減緩腫瘤的生長,而過度表達則會加速腫瘤的生長。而且,正常細胞缺乏THOR的正常發(fā)育,表明它只對癌細胞有影響。
沉默THOR“抑制細胞增殖”
Chinnaiyan教授說,他們經(jīng)歷了“很多l(xiāng)ncrna”,其中大多數(shù)沒有顯示出像THOR這樣的清晰的功能。
在進一步的實驗中,研究小組發(fā)現(xiàn),THOR與胰島素樣生長因子結合蛋白(IGFBPs)相互作用,后者被認為有助于保持rna的穩(wěn)定。他們發(fā)現(xiàn)沉默的THOR阻止了IGFBPs的活動。
Chinnaiyan教授說:“如果我們擾亂了THOR的功能,我們就會破壞穩(wěn)定RNA的能力。”抑制細胞增殖。研究人員還發(fā)現(xiàn),過度表達THOR會使細胞生長得更快。
他們認為,THOR可能是抗癌藥物的靶點,因為它不會干擾健康細胞。
“我們發(fā)現(xiàn)THOR是一個高度保守的lncRNA,這是令人興奮的事實。”
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