根據(jù)臨床表現(xiàn)中有典型的腹痛、寒戰(zhàn)高熱和黃疸的三聯(lián)癥，即夏柯征(Charcot)，以及病情發(fā)展中又出現(xiàn)中樞神經(jīng)系統(tǒng)抑制和低血壓等臨床表現(xiàn)，急性化膿性膽管炎的診斷，一般并不困難。僅在少數(shù)病人，例如肝內(nèi)膽管結石并發(fā)的急性化膿性膽管炎，因癥狀不典型，如無腹痛和黃疸等，有時會延誤診斷。此時，可借助于某些特殊檢查方法，如B超等作非損傷性檢查，常可顯示肝內(nèi)或肝外膽管擴張、肝內(nèi)多發(fā)性小膿腫，以及膽管內(nèi)結石影，從而推斷膽管內(nèi)有梗阻性病變的存在，再結合臨床表現(xiàn)來作出診斷。偶爾也可以通過PTC或ERCP等檢查來輔助診斷。

 對于典型病例一般較易作出診斷，但應與以下疾病相鑒別。
1.消化性潰瘍穿孔患者有潰瘍病史，腹肌呈板狀強直，肝濁音區(qū)縮小或消失，膈下有游離氣體等可確診。
2.膈下膿腫B超檢查可發(fā)現(xiàn)膿腫的部位和大小，CT檢查能可靠定位，并可看出膿腫與周圍臟器的關系。
3.急性胰腺炎血、尿淀粉酶或血清脂肪酶升高。B超檢查可發(fā)現(xiàn)胰腺呈局限性或彌漫性增大可與之鑒別，必要時可行CT檢查進一步確定病變部位和程度。
4.肝膿腫B超、CT等影像學檢查與急性化膿性膽管炎易于鑒別。
5.右下細菌性肺炎可通過其典型癥狀、體征及胸部X線檢查確診。