過敏性結膜炎最常見的癥狀是眼癢，幾乎所有的過敏性結膜炎患者均可出現(xiàn)，但眼癢并非其特有的癥狀。不同亞型的過敏性結膜炎眼癢程度不同，其中春季角結膜炎通常表現(xiàn)最為明顯。其他較常見的癥狀有流淚、灼熱感、畏光及分泌物增加等。分泌物多為黏液性，呈黏稠的絲狀。一些較嚴重的過敏性結膜炎，如春季角結膜炎及異位性角結膜炎有時可以出現(xiàn)視力下降。
過敏性結膜炎最常見的體征為結膜充血，充血的程度跟病情嚴重程度及病程長短有一定的關系。結膜乳頭增生是另一個常見的體征，乳頭多出現(xiàn)于上瞼結膜。巨乳頭性結膜炎及春季角結膜炎增生的乳頭有其特異的形態(tài)特征。異位性角結膜炎常出現(xiàn)結膜纖維化(瘢痕)改變。季節(jié)性過敏性結膜炎發(fā)作時還可出現(xiàn)結膜水腫，在小孩尤為多見。角膜損害在不同的亞型過敏性結膜炎發(fā)生的幾率不同，以春季角結膜炎及異位性角結膜炎最常見，而季節(jié)性過敏性結膜炎、常年性過敏性結膜炎及巨乳頭性結膜炎則較少發(fā)生。
許多過敏性結膜炎缺乏特征性的癥狀與體征。診斷時需要仔細詢問病史，如家族及個人過敏史、用藥史、接觸鏡配戴史、發(fā)病的季節(jié)、發(fā)病的時間與快慢，病程的長短等，同時密切結合其臨床表現(xiàn)，必要時需輔以實驗室檢查。
季節(jié)性結膜炎有其特殊的病史及臨床表現(xiàn)，診斷并不困難。對一些不典型的病例可作結膜的病理活檢或結膜刮片做細胞學檢查。大多數(shù)病例發(fā)作期常見較多嗜酸性粒細胞，或由于嗜酸性粒細胞變性崩解核消失，而遺留成堆的嗜酸性顆粒，同樣有診斷意義。此外可作血清或淚液的IgE含量測定，不但可協(xié)助診斷，還可作預測病程的指標。

變應性結膜炎應與下列疾病進行鑒別診斷：
1.干眼綜合征 變應性結膜炎特別難以與干眼綜合征相鑒別，因為兩種疾病都存在間歇性加重的輕度結膜血管擴張和燒灼感。在變應性眼病的癥狀中很少有異物感，但在干眼癥則很常見。干眼患者有發(fā)生變應性結膜炎的趨向，原因是淚液在結膜表面的稀釋和沖洗變應原的能力受到了破壞。眼瞼炎、瞼板腺腫大和瞼緣炎可能與葡萄球菌感染和(或)皮脂溢有關。與眼瞼炎相關的癥狀和體征有燒灼感、眼瞼紅斑、結膜充血、泡沫狀淚膜、眼瞼秕糠和瞼緣碎屑等。
2.感染性結膜炎 無季節(jié)性，睡醒時較重。早晨起床時，睫毛和眼瞼常常粘在一起。其分泌物為漿液性和膿性不等。致病菌包括淋病奈瑟菌、腦膜炎奈瑟球菌、肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌、葡萄球菌屬、莫拉菌、衣原體和病毒。結膜刮片顯示上皮細胞漿內嗜堿性包涵體是衣原體感染的特征。相反，變應性結膜炎通常有季節(jié)性，分泌物多呈黏絲狀或黏稠狀，細菌培養(yǎng)陰性。
3.春季角結膜炎 是一多發(fā)于小年齡組(8～20歲)的疾病，主要表現(xiàn)為嚴重的癢感、燒灼感和黏性分泌物。上瞼結膜有巨大乳頭和鋪路石樣乳頭。可涉及角膜，但盾形潰瘍并不常見。
4.特應性角結膜炎 可發(fā)生于各年齡組，常伴有嚴重的并發(fā)癥。臨床癥狀和體征為伴隨嚴重癢感和燒灼感的慢性滲出性結膜炎。臨床檢查發(fā)現(xiàn)：瞼緣增厚、角膜病變(包括血管翳、角膜炎和潰瘍)和慢性紅眼。常伴隨圓錐角膜、囊下和極性白內障，以及易發(fā)葡萄球菌和單純皰疹病毒感染。同時伴有特應性皮炎，特別是眼瞼皮膚和眼附屬器的炎癥。
5.巨乳頭結膜炎 多發(fā)生于配戴接觸鏡或義眼的人群。暴露的縫線也可誘發(fā)該病。翻轉上眼瞼可顯示與接觸鏡、義眼或縫線位置相對應的巨大濾泡。其癥狀包括充血、燒灼感、癢感和黏性分泌物。
6.接觸性變應性結膜炎 接觸性變應性結膜炎的急性期特征為紅斑、結膜水腫、眼瞼硬結和水腫。該反應屬于Ⅳ型細胞介導性遲發(fā)型超敏反應。在慢性期表現(xiàn)為眼瞼的殼狀化和地衣化。受累區(qū)多為與毒性物質相接觸的區(qū)域。對美容物品或眼科藥品的致敏是常見的致病原因，如局部用新霉素、阿托品和防腐劑等。在個別病例會發(fā)生上皮缺損、角膜混濁和角膜炎等并發(fā)癥。