潛伏期3～5天，有低熱、全身不適、腹痛等前驅(qū)癥。1～2天內(nèi)口腔、咽、軟腭、頰黏膜、舌、齒齦出現(xiàn)疼痛性粟粒至綠豆大小水皰，周圍繞以紅暈，破潰成小潰瘍，由于疼痛，常流涎和拒食。同時手足亦出現(xiàn)皮疹，在手足的背側面和手指(趾)背側緣、甲周圍、掌跖部，出現(xiàn)數(shù)目不定的水皰，除手足口外，亦可見于臀部及肛門附近，偶可見于軀干及四肢，數(shù)天后干涸、消退，皮疹無瘙癢，無疼痛感。個別兒童可出現(xiàn)泛發(fā)性丘疹、水皰，伴發(fā)無菌性腦膜炎、腦炎、心肌炎等。一般經(jīng)過良好，全病程約5～10天，多數(shù)可自愈，預后良好。
手足口病發(fā)生時，病兒常以發(fā)熱起病，其熱度不等，也有不發(fā)熱者，但以低熱者居多約點半數(shù)。且常伴有流涎、流涕、口痛、咽痛及厭食等癥狀。臨床以口腔、手足皰疹為主要特征?？谇话捳钜娪谏唷㈩a粘膜、硬腭、口唇、咽及扁桃體，約3mm大小，并迅速破潰形成潰瘍。皮疹多見于手足遠端、手指指間，足跟邊緣和甲周，手掌和足跖亦多見，下肢及臀部可呈密集分布的丘疹樣皮疹，初起為斑丘疹，后轉(zhuǎn)變?yōu)榘捳?，圓形或橢圓形，約3~7mm如米粒大小，較水痘皮疹為小，質(zhì)地較硬，周圍有紅暈。皰疹數(shù)目少的僅幾個，多的幾十個。一般病程較輕而短，多于1周左右痊愈，皮疹消退后不留瘢痕或色素沉著，如有繼發(fā)感染常使皮膚損害加重。
手足口病一年四季均可見到，以夏秋季較多。發(fā)病初期先有發(fā)熱、咳嗽、流涕和流口水等像上呼吸道感染一樣，有的孩子可能有惡心、嘔吐等癥狀。以后手、足的指及趾背部出現(xiàn)橢圓形或梭形的水泡，皰的周圍有紅暈，水皰的液體清亮，水皰的長軸與皮紋是一致的。然后水皰的中心凹陷、變黃、干燥、脫掉(脫屑)。另外指、趾端有散在的比較堅硬的淡紅色丘疹或者皰疹。同時，在口腔里，如嘴唇、舌、口腔粘膜、齒齦上也有散在的水皰，但口腔里的水皰很快破潰而形成灰白色的小點或灰白色的一層膜，其周圍有紅暈，在灰白色的膜下可以見到點狀或片狀的糜爛面。手足口病是由病毒感染引起的，感染源為皰疹液、咽喉分泌物、糞便污染的手、玩具、食具等。它的潛伏期是3—8日。
根據(jù)流行病學特點，口腔、手、足出現(xiàn)皰疹，咽拭子、血液及皰液中分離培養(yǎng)出COX A19病毒可確診。

手足口病應與口蹄疫相鑒別。
一、病原體不同?？谔阋叩牟≡w為口蹄疫病毒，屬于人畜共患病原體。手足口病是由數(shù)種腸道病毒感染所致。
二、傳染源不同?？谔阋卟《局灰鹋继泐?兩半蹄子)動物牛、羊、豬、鹿、駱駝等發(fā)生口蹄疫，成為人患口蹄疫的傳染源。只有先出現(xiàn)獸疫，才有可能使人患病。手足口病的傳染源是患者和腸道攜帶病毒的人，屬于人類疾病。
三、傳播途徑不同?？谔阋呤峭ㄟ^接觸病畜口腔、蹄冠部的潰瘍爛斑，經(jīng)皮膚粘膜感染的;偶而也有食用了被病毒傳染而又未加熱(巴氏消毒)的奶感染的。因此，人患口蹄疫是極為散在發(fā)生的。手足口病是由于接觸病人，通過日常生活用品、食具、玩具的污染經(jīng)口感染的，也可通過呼吸道傳播。因此，可出現(xiàn)不同規(guī)模的流行。
四、發(fā)病人群不同。人患口蹄疫決定于與病畜的接觸，發(fā)病人群的年齡廣泛，但由于易感性很低，發(fā)病機會很少。兒童和老年人一旦患病癥狀較重。手足口病主要是幼兒傳染病，3歲以下患兒占絕大多數(shù)不清，很少超過5歲以上者。1983年天津市流行手足口病，3歲以下兒童發(fā)病率為32.85‰，3~6歲為14.23‰，7~14歲為1.27‰，15歲以上0.05‰。常在托幼機構出現(xiàn)流行。
五、癥狀體片不同?？谔阋?、手足口病雖患病部位在口腔、手指間、足趾端有相似之處，但癥狀體征各有不同。
口蹄疫起病后主要表現(xiàn)為全身中毒癥狀和局部皰疹損害兩大特征。出現(xiàn)發(fā)熱、頭痛、全身不適，1~2天后在口腔粘膜、舌邊、手指間、足趾端發(fā)生水皰，再1~2天水泡破潰，形成爛斑，繼發(fā)感染成膿皰，然后結痂、脫落，一般不留瘢痕。病程1~`2周，大多預后良好，嚴重病例可并發(fā)心肌炎。手足口病大多無發(fā)熱或低熱，但有呼吸道感染癥狀。先在口腔粘臘出現(xiàn)皰疹，分布和頰粘膜、齒齦、舌邊，并破潰成潰瘍。隨即在手指、足部、臀部、膝部出現(xiàn)丘疹，第二天只有少部分丘疹形成皰疹，如綠豆、赤小豆大，單個性不融合，內(nèi)含透明液體，終不破潰，3~5天自行吸收收縮。全身癥狀輕，病程約一周，預后良好。
六、診斷依據(jù)不同?？谔阋咝柘扔挟?shù)厣罂谔阋甙l(fā)生或流行，并有與病畜接觸機會，或飲用病畜污染而未加熱的奶等感染關系。潛伏期2~18一友3~8天常見;發(fā)病具有全身中毒癥狀及局部皰疹、潰瘍損害兩大特征。
需與皰疹性咽峽炎、單純皰疹等相鑒別。