一種基因融合檢測算法SOAPfuse,在深圳華大基因開發(fā)成功。該算法提高了基因融合的檢測效率,推動疾病尤其是腫瘤的研究,對臨床分子分型和腫瘤新藥的開發(fā)具有重要意義。
深圳華大基因26日向此間媒體介紹,該算法具有準(zhǔn)確率高、敏感性強、精度高、資源消耗少等優(yōu)點,采用局部窮舉算法和一系列精細的過濾策略,對基因融合進行快速、精確的檢測。
基因融合是指染色體上兩個異位的基因嵌合在一起,形成一個嵌合基因的現(xiàn)象。這種現(xiàn)象一般是由于染色體發(fā)生易位、缺失或者倒置造成的,它們在癌癥的發(fā)生上扮演著重要的角色,并且可以作為診斷和治療癌癥的靶標(biāo)?;蛉诤犀F(xiàn)象最早在血液系統(tǒng)惡性腫瘤中被發(fā)現(xiàn),其中以慢性粒細胞白血病中BCR-ABL基因融合最為經(jīng)典。隨著對基因融合的深入研究,科研人員發(fā)現(xiàn),除血液系統(tǒng)腫瘤外,在實體瘤中也存在著基因融合現(xiàn)象。
傳統(tǒng)基因融合研究方法具有通量低、操作復(fù)雜、不便于大規(guī)模樣品篩查的缺點。新算法—SOAPfuse首先通過比對到基因組和轉(zhuǎn)錄本中雙末端(pairend)關(guān)系的序列尋找候選的基因融合,然后采用局部窮舉算法和一系列精細的過濾策略,在盡量保留真實融合的情況下過濾掉其中假陽性的基因融合。
模擬數(shù)據(jù)和真實驗證數(shù)據(jù)的綜合測評表明,SOAPfuse與其他方法相比具有更高的靈敏度和特異性,并且可以大大減少資源消耗。此外,該算法還具有融合斷點預(yù)測和可視化功能。
用于防治各種原因引起的白細胞減少癥,急性粒細胞減少癥,尤其是對腫瘤化學(xué)和放射治療以及苯中毒等引起的白細胞減少癥。
健客價: ¥8.5益肺清化膏:益氣養(yǎng)陰、清熱解毒、化痰止咳。適用于氣陰兩虛所致氣短、乏力、咳嗽、咯血、胸痛;晚期肺癌見上述證候者的輔助治療。 鴉膽子油軟膠囊:抗癌藥。用于肺癌,肺癌腦轉(zhuǎn)移,消化道腫瘤及肝癌的輔助治療劑。
健客價: ¥5000苗醫(yī):布苯怡象,麥靚麥韋艿曲靳,怡窩雄訪達用于放化療引起的白細胞減少、精神不振。 中醫(yī):解毒散結(jié),補氣養(yǎng)血。用于中晚期癌癥的輔助治療以及癌癥放化療引起的白細胞減少癥屬氣血兩虛者。
健客價: ¥130解毒,消腫,止痛。用于中、晚期腫瘤,慢性乙型肝炎等癥。
健客價: ¥178補硒藥。適用于低硒的腫瘤、肝病、心腦血管疾病病人或其他低硒引起的疾病。
健客價: ¥39扶正祛邪,軟堅散結(jié)。用于消化道惡性腫瘤,乳腺惡性腫瘤,肺惡性腫瘤見于氣血瘀阻證者。
健客價: ¥205.5廣譜抗腫瘤藥,用于胃癌、食管癌、賁門癌、腸癌等消化道腫瘤的治療,以及消化道盒呼吸道腫瘤圍手術(shù)期化療,術(shù)后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的預(yù)防用藥,并可用于抑制各種胃癌、食管癌、腸癌等的癌前病變。
健客價: ¥990補氣養(yǎng)血,健脾益腎。適用于癌癥應(yīng)用放、化療所致白細胞減少及因放、化療引起的頭暈頭昏,倦怠乏力、消瘦、惡心嘔吐等癥。
健客價: ¥40補氣養(yǎng)血、健脾益腎。適用于癌癥應(yīng)用放、化療所致白細胞減少及因放、化療引起的頭暈頭昏、倦怠乏力、消瘦、惡心嘔吐等癥。
健客價: ¥50活血化瘀,消腫止痛。用于肺、肝、胃等多種癌癥引起的疼痛。
健客價: ¥42補氣養(yǎng)血,健脾益腎。適用于癌癥應(yīng)用放、化療所致白細胞減少及因放、化療引起的頭暈頭昏,倦怠乏力、消瘦、惡心嘔吐等癥。
健客價: ¥55活血化瘀,消腫止痛。用于肺、肝、胃等多種癌癥引起的疼痛。
健客價: ¥79心血管疾病,如病毒性心肌炎、慢性心功能不全;肝炎,如病毒性肝炎、亞急性肝壞死、慢性活動性肝炎;癌癥的綜合治療,能減輕放療、化療等引起的某些不良反應(yīng)。
健客價: ¥15解毒,消腫,止痛。用于中、晚期腫瘤,慢性乙型肝炎等癥。
健客價: ¥175補五臟虛勞;抗衰老;抑制腫瘤。
健客價: ¥98補五臟虛勞;抗衰老;抑制腫瘤。
健客價: ¥134補五臟虛勞;抗衰老;抑制腫瘤。
健客價: ¥210補五臟虛勞;抗衰老;抑制腫瘤。
健客價: ¥580用于治療各種原因引起的白細胞減少癥,如放射性、抗腫瘤藥物等所致的白細胞減少癥。
健客價: ¥32本品為非甾體抗炎藥,且有鎮(zhèn)痛,解熱作用,用于風(fēng)濕性或類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎,腫瘤止痛及腫瘤血液病退熱。
健客價: ¥5.8關(guān)愛精英是一款針對中青年的常規(guī)體檢套餐,在健康篩查的基礎(chǔ)上針對血脂、肝功能、腫瘤標(biāo)記物等檢查項目進行了細化,特別關(guān)注高血脂、肝病等慢性病及常見腫瘤的篩查。
健客價: ¥606本品用于下列疾病的輔助治療: 1.心血管疾病,如:病毒性心肌炎、慢性心功能不全。 2.肝炎,如:病毒性肝炎、亞急性肝壞死、慢性活動性肝炎。 3.癌癥的綜合治療:能減輕放療、化療等引起的某些不良反應(yīng)。
健客價: ¥331.心血管疾病,如病毒性心肌炎、慢性心功能不全;2.肝炎,如病毒性肝炎、亞急性肝壞死、慢性活動性肝炎;3.癌癥的綜合治療,能減輕放療、化療等引起的某些不良反應(yīng)。
健客價: ¥16清熱解毒、消腫散結(jié)。用于肺炎、闌尾炎、蜂窩組織炎屬熱毒壅盛證侯者,并可用于癌癥輔助治療。
健客價: ¥18